建湖县境地面真高为里下河平原最低地区之一，与兴化、宝应共称为三大洼，建湖为下洼。境内最高处为走马沟两岸，俗称西高田，地面真高在2.2米左右，最高3米。全县平均地面真高为1.74米左右，最低处有的不到0.4米。（《建湖县志·大事记》）

　　建湖县气候温润，年均日照率在50%左右，近23年为49%；年均气温为14.2°C，近23年为14.8°C；年均地表温度为17.5°C，近23年略低，为17.3°C。1978年为日照时数最多的年份，在57%；最少年份为1989年，仅为44%。日极端最高气温出现在1966年8月8日，为38.2°C；最低气温出现在1969年2月6日，为－16.6°C。日极端最高地表温度出现在1994年7月9日，为68.9°C；最低地温出现在1969年2月6日，为－20.9°C。

　　降水方面，年均降水量在1000毫米左右，年际变化较大，近23年年平均为969毫米。最多年份为1991年，达1658.4毫米；最少年份为2004年，只有459.7毫米。一个月的最大降水量达619毫米，发生在1965年7月；日最大降水量为234毫米，发生在1974年7月12日。（《盐城市志·辖县概况》、《建湖县志·自然环境》、《建湖县志1986～2008·区位环境人口》）

　　境内最大湿地为以九龙口为中心的沙村荡，原为马家荡的一部分，总面积为141平方公里，县境内总面积约40平方公里，其中荡滩面积为30平方公里。1985年12月，建湖县政府决定将九龙口区域列为自然保护区。2001年，被江苏省人民政府列为省级风景名胜区。2005年10月，九龙口自然保护区被列为国家AA级旅游景区与保护区。（《建湖县志·自然环境》，《建湖县志1986～2008·区位环境人口》、《经济》）